Mélodie Caballero
Caballero Mélodie
+33 5 57 12 23 91
Technicienne de la Recherche INRAE
Equipe VIRO

PARCOURS

2002 - Baccalauréat Technologique Sciences et Recherches Laboratoires (Lycée Borde-Basse Castres)
2004 - DUT Génie Biologique Option Agronomie (Paul Sabatier Toulouse)

2004 - INRA UMR LSTM Montpellier (stagiaire -4mois-)
2005-2007 - CIRAD-INRA UMR BGPI Montpellier (TRNO)
2008 - INRA UMR GDPP Bordeaux (TRNO 8mois)
2008 - INRA UMR BFP1332 Virologie Concours Externe TRNO

THEMES / MISSIONS DE RECHERCHE

Technicienne de recherche en charge de l’étude du comportement de plantes face à l’infection virale (phénotypage et génotypage des interactions plantes-virus).
Je travaille dans l’Unité Mixte de Recherche 1332 Biologie du Fruit et Pathologie dans l’équipe de Virologie Végétale au sein de la composante « génétique ». Les travaux de l’équipe de Virologie Végétale portent sur les virus phytopathogènes à ARN, plus précisément les potyvirus infectant les plantes. Les recherches de l’équipe sont structurées en plusieurs axes en interaction forte.

  • Je travaille au sein de 2 axes de recherches qui sont :
    1/ Analyse de la réponse de la plante aux virus en conditions multi-stress : bases génétiques de la tolérance.
    2/ Génétique, génomique et recherche translationnelle chez les espèces fruitières à noyau : transformer les connaissances acquises sur les interactions plantes-virus en stratégies de résistance.
  • Mes principales missions :
    1/ Mise en place et réalisation des expériences de phénotypage et de génotypage dans l’objectif d’étudier les interactions plantes-virus, pour un collectif de chercheurs.
    2/ Encadrement et suivi technique de stagiaires en formation (depuis Licence/BTS jusqu’au niveau Doctorant) et de contractuel niveau TR.
  • Mes missions transverses :
    1/ Gestion d’un certain nombre de réactifs pour le collectif du laboratoire (stocks de tampons pour extraction de particules virales type « Bertheau » et de réactifs pour les tests sérologiques type ELISA).
    2/ Mise à jour de protocoles utilisés par le collectif.
    3/ Référente de la machine LightCycler® 480 (Q-PCR) et gestion du stock des réactifs/consommables.
    4/ Responsable de la pièce commune « Extraction » et de la pièce dite « Prunus ».
    5/ Référente « Sécurité Incendie » de l’équipe Virologie Végétale pour l’UMR 1332 BFP.
    6/Référente « Sauveteur Secouriste du Travail » de l’équipe de Virologie Végétale pour l’UMR 1332 BFP.

DOMAINES DE COMPETENCE / SPECIALITES SCIENTIFIQUES 

Responsable de la mise en place et de la gestion du déroulé/planning des expérimentations, principalement sur la plante modèle Arabidopsis thaliana

  • Planification de la production de plantes nécessaire aux essais.
  • Gestion d’un calendrier d’activités et d’un programme de tests de phénotypage.
  • Préparation de produits de base (tampons, réactifs, solutions…).
  • Tenue d’un cahier de laboratoire et compilations.
  • Analyse et mise en forme des résultats.
  • Présentation des résultats obtenus.

TECHNIQUES/SPECIALITES MAITRISEES

Expérimentations en serre et en laboratoire de biologie moléculaire et observations en microscopie à fluorescence

  • Inoculation mécanique, biolistique et par Agrobacterium de plantes par différents virus (CMV, PPV, TuMV, TMV) en serres (niveau de confinement de type S2 ou S3) ou en chambre de culture.
  • Suivi des plantes, observations et notations.
  • Prélèvements de plantes pour réaliser des tests sérologiques ou moléculaires en laboratoire.
  • Réalisation de tests sérologiques dits ELISA (détection spécifique de virus : PPV/CMV/TuMV/TMV ou avec des anticorps polyvalents : poly potyvirus).
  • Extractions d’ADN et d’ARN, suivies de PCR ou RT-PCR.
  • Synthèse d’ADN complémentaire à partir d’une matrice ARN (ADNc).
  • Electrophorèse sur gel d’agarose ou sur séquenceur type LICOR.
  • PCR quantitative ou en temps réel (LightCycler® 480).
  • Observations en microscopie de virus taggués avec le gène codant pour la fluorescence verte (GFP) à l’AXIOZOOM.
  • Analyses d’images avec le logiciel Image J.